結古寺位于玉樹結古鎮(zhèn)東結古山上，藏語稱“結古頓珠楞”意為“結古義成洲”.結古寺是玉樹北部地區(qū)的薩迦派主寺。最初，結古寺原是苯教的寺院，后來改宗噶舉派。蒙元時期，忽必烈的國師八思巴途徑結古地區(qū)，開始于是逐步將當地寺廟改宗。到了明代，結古寺終于變?yōu)樗_迦派寺院。
迦派寺院圍墻上會涂有象征文殊、觀音和金剛手菩薩的紅、白、黑三色花條。
結古寺以建筑宏偉、寺僧眾多、文物豐富、多名僧高徒在我國藏區(qū)聞名遐邇。整個寺院依山勢而建，殿堂僧舍錯落有致，遠望似多層樓閣聳立，主體建筑“都文桑舟嘉措”經堂系由薩迦寺大堪布巴德秋君和嘉那活佛第一世多項松卻帕文設計，在德格佐欽寺支持下，扎武邁根活佛主持修建，可容納1000扎哇誦經。此外，講經院、大昭殿、彌勒殿、嘉那和文保活佛院等都規(guī)模較大，且各具特色。最盛時，全寺成年扎哇多達780人，完德400 多人。曾出過許多有學識的比丘，擔任講經院的堪布，尊為 “喇嘛”（上師 ）。
較出名的如喇嘛囊嘎，著有《般若波羅蜜多釋》等5部著作，喇嘛才江是當代玉樹名醫(yī)；喇嘛日霍，擅長歷史，著有《大日如來佛堂志》及〈〈藏區(qū)文物志〉〉等。該寺原藏有嘎阿尼當巴的牦、八思巴所贈釋迦牟尼唐卡、護法面具和檀香度母、古印度鈴杵、傳為格薩爾用過的釵鈸和扎武部落從故居象雄帶來的寶刀等。由于結古寺盛名遇逸遐邇，加之地處結古鎮(zhèn)，曾來許多名人，1937年藏歷十二月一日，九世班禪卻吉尼瑪圓寂于此。嘉那佛是該寺最大活佛，與內地關系非常密切，故稱“嘉那朱古”（漢族活佛之意），嘉那佛獨創(chuàng)了稱為“多頂求卓”的100多種舞蹈，從而使玉樹成為歌舞之鄉(xiāng)。
結古寺的嘛尼石堆聞名于世界，第一世嘉那活佛晚年時定居于鎮(zhèn)東新寨村，并在此修建嘛尼堆，人稱“嘉那嘛尼堆”、“新寨嘛尼堆”.隨著歲月的流逝，這里的嘛尼石堆體積越來越大，200多年間堆積25億多塊嘛尼石，堪稱“世界第一大嘛尼堆”,成為藏族宗教文化的優(yōu)秀代表。
結古寺原有3名活佛：扎武邁根·松杰丹增，玉樹縣巴塘鄉(xiāng)人，1954年被迫還俗在家，1958年卒，其轉世現居印度；文保堅貢亦歿于1958年，其轉世住扎武百戶在印度所建之結古寺，嘉那活佛，其第一世名多項松卻帕文，昌都囊同人，父親旦正，母親阿吉，青年時期于峨嵋山、五臺山等地居留20余年，清通漢語文，服飾略似和尚，故稱之為“嘉那朱古”（漢活佛）。他多才多藝，獨創(chuàng)了稱為嚴“多頂求卓”的100多種舞蹈，玉樹地區(qū)著名的卓舞即源于此。晚年定居結古鎮(zhèn)東新寨村東面山坡，并在新寨修建麻尼堆，人稱“嘉那麻尼”.該麻尼堆由刻有六字真言的麻尼石壘成，隨著歷年添加，體積越來越大，至1955年，麻尼石已達25億塊，有“世間第一大麻尼堆”之稱。現世嘉那活佛更嘎堅贊，生于1950年。
結古寺于1980年10月30日批準開放。現為省級重點文物保護單位。
